También existe un riesgo raro pero sumamente grave de perforación intestinal, un desgarro accidental en el colon que requiere cirugía de emergencia.
Además, este examen no es apto para cualquier persona. Aquellos pacientes que sufren brotes agudos de enfermedades inflamatorias severas, como megacolon tóxico, tienen estrictamente prohibida la colonoscopia por el alto riesgo de ruptura.
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